Curso de Extensão Profissional em Bioinformática Marinha
Neste curso de extensão profissional você aprende a analisar os grandes volumes de dados genômicos que a pesquisa marinha gera hoje. Você vai aprender a trabalhar na linha de comando do Linux, programar em Python e R, montar e anotar genomas de organismos marinhos, analisar metagenomas e transcriptomas, usar os principais bancos de dados biológicos e construir pipelines reprodutíveis, com exemplos aplicados à microbiologia, à biodiversidade, à aquicultura e à bioprospecção.
Avaliação de conhecimentos prévios
Estas são as competências que este programa oferece. Marque as que você já domina e diremos qual parte do conteúdo é para você.
Você está começando do zero nesta área. O programa foi pensado justamente para isso.
O que é o Curso de Extensão Profissional em Bioinformática Marinha?
Neste curso de extensão profissional você aprende a analisar os grandes volumes de dados genômicos que a pesquisa marinha gera hoje. Partindo do zero, você vai aprender a trabalhar na linha de comando do Linux e em servidores remotos, programar em Python e R com Biopython, pandas e Bioconductor e lidar com dados de sequenciamento e bancos de dados públicos. Depois, vai montar, anotar e comparar genomas de microrganismos marinhos, peixes e invertebrados, caracterizar comunidades microbianas com metagenômica, quantificar a expressão gênica com transcriptômica e reunir tudo em pipelines documentados e reutilizáveis.
O diferencial deste curso de extensão: programação do zero, com Linux, Python e R voltados para dados biológicos; dados marinhos reais, com genomas, metagenomas e transcriptomas de projetos públicos; ferramentas abertas, o software padrão usado em laboratórios do mundo todo; reprodutibilidade, com gerenciadores de pipelines, ambientes de software e controle de versão; e um caso prático em que você faz uma análise bioinformática completa do início ao fim.
Destaques do programa
- Programação do zero: Linux, Python e R voltados para dados biológicos.
- Dados marinhos reais: genomas, metagenomas e transcriptomas de projetos públicos.
- Ferramentas abertas: software padrão usado em laboratórios do mundo todo.
- Reprodutibilidade: gerenciadores de pipelines, contêineres e controle de versão.
- Dados FAIR: metadados, padrões e publicação responsável de dados genéticos.
- Caso prático: uma análise bioinformática completa do início ao fim.
Grade curricular do Curso de Extensão Profissional em Bioinformática Marinha
8 módulos. Selecione um módulo para ver o conteúdo.
Linux e ambientes computacionais
- 1.1. Sistema de arquivos e comandos básicos
- 1.2. Manipulação de arquivos de texto
- 1.3. Scripts em Bash
- 1.4. Gerenciamento de pacotes com Conda
- 1.5. Servidores e conexão remota
- 1.6. Sistemas de filas de jobs
- 1.7. Computação em nuvem
- 1.8. Boas práticas de organização
Programação em Python e R
- 2.1. Tipos e estruturas de dados
- 2.2. Controle de fluxo e funções
- 2.3. Leitura de formatos biológicos
- 2.4. Biopython
- 2.5. Tabelas de dados com pandas
- 2.6. R e Bioconductor
- 2.7. Estatística básica
- 2.8. Visualização de dados
Dados de sequenciamento e bancos de dados
- 3.1. Plataformas de sequenciamento
- 3.2. Formatos FASTA e FASTQ
- 3.3. Controle de qualidade das leituras
- 3.4. Bancos de dados de sequências
- 3.5. Bancos de dados de proteínas
- 3.6. Repositórios de dados marinhos
- 3.7. Metadados e padrões
- 3.8. Download e gestão de dados
Genômica de organismos marinhos
- 4.1. Montagem de genomas
- 4.2. Leituras curtas e longas
- 4.3. Avaliação das montagens
- 4.4. Anotação de genes
- 4.5. Genômica comparativa
- 4.6. Filogenômica
- 4.7. Genomas de microrganismos
- 4.8. Genomas de peixes e invertebrados
Metagenômica marinha
- 5.1. Metabarcoding versus metagenômica
- 5.2. Montagem de metagenomas
- 5.3. Genomas montados a partir de metagenomas
- 5.4. Perfis taxonômicos
- 5.5. Perfis funcionais
- 5.6. Clusters de genes biossintéticos
- 5.7. Diversidade e estatística
- 5.8. Projetos oceânicos de referência
Transcriptômica e proteômica
- 6.1. Desenho de experimentos de expressão
- 6.2. Alinhamento e quantificação
- 6.3. Expressão diferencial
- 6.4. Montagem de transcriptomas de novo
- 6.5. Análise de enriquecimento funcional
- 6.6. Resposta ao estresse ambiental
- 6.7. Introdução à proteômica
- 6.8. Integração de dados ômicos
Pipelines reprodutíveis
- 7.1. Controle de versão com Git
- 7.2. Notebooks interativos
- 7.3. Gerenciadores de pipelines
- 7.4. Contêineres de software
- 7.5. Documentação das análises
- 7.6. Princípios FAIR
- 7.7. Publicação de dados
- 7.8. Ética e dados genéticos
Caso prático: análise bioinformática marinha
- 8.1. Formulação da pergunta
- 8.2. Obtenção dos dados
- 8.3. Controle de qualidade
- 8.4. Análise principal
- 8.5. Análise estatística
- 8.6. Visualização
- 8.7. Interpretação biológica
- 8.8. Apresentação do caso
Duração e modalidade do Curso de Extensão Profissional em Bioinformática Marinha
São 800 horas. Diga quantas você pode dedicar por semana e mostraremos quando você vai realmente terminar.
É o ritmo com que a maioria dos alunos conclui o programa. Combina bem com o plano parcelado.
Direção acadêmica e corpo docente
A equipe docente da Navalis: profissionais em atividade que ministram e supervisionam os programas.
Dra. Marina AlcoverDiretora acadêmica e responsável pela garantia da qualidade
Eng. Diego CifuentesProfessor titular de Soldagem Naval e Ensaios Não Destrutivos; chefe de QA/QC de juntas soldadas
Cmte. Javier Abaroa (MCA)Professor titular de Manobra, Navegação Eletrônica (ECDIS/Radar/ARPA) e GMDSS; coordenador de conformidade com a STCW e de gerenciamento de recursos de passadiço
Dr. Pau FerrerProfessor titular de Arquitetura Naval e Simulação; diretor do Laboratório de Hidrodinâmica e CFD
Dra. Nuria LlobregatProfessora titular de Meteorologia Marinha, SAR e Segurança Operacional; coordenadora de gestão de riscos de navegação
Eng. Javier BañulsProfessor titular de Engenharia Elétrica, Automação e Engenharia ETO; coordenador de integração eletrônica e alarmes de máquinas
Eng. Sofía MarquinaProfessora titular de Materiais, Compósitos e Proteção Anticorrosiva; coordenadora da linha de tintas e revestimentos avançados
Eng. Tomás RieraProfessor titular de Propulsão, Energias Alternativas e Sistemas Híbridos; coordenador de eficiência energética e vibraçõesObjetivos do Curso de Extensão Profissional em Bioinformática Marinha
Oportunidades de carreira após o Curso de Extensão Profissional em Bioinformática Marinha
Dúvidas sobre o Curso de Extensão Profissional em Bioinformática Marinha
Não. O programa parte do zero com Linux, Python e R.
Não. As análises pesadas rodam em ambientes computacionais remotos, que são explicados durante o programa.
Sim. Você usa dados públicos de projetos de sequenciamento marinho.
Sim. As ferramentas são gerais, embora os exemplos foquem organismos marinhos.
Uma análise bioinformática completa, da obtenção dos dados à interpretação biológica e à apresentação.
Totalmente a distância, por meio de um campus virtual disponível 24 horas por dia, 7 dias por semana, com sessões ao vivo gravadas e tutorias com a equipe acadêmica.
O curso de extensão profissional é oferecido a distância e tem 800 horas de estudo distribuídas em 8 módulos de cerca de 100 horas cada, terminando com um caso prático em que você aplica o que aprendeu a uma análise bioinformática completa.
Mais programas em Biologia e conservação
Processo de admissão
Sem esperar por um retorno por telefone. Se seus documentos estiverem em ordem, você se matricula na mesma sessão.
- Perfil: voltado a graduados em biologia, ciências do mar ou biotecnologia que querem aprender bioinformática, técnicos de laboratório que geram dados de sequenciamento, pesquisadores que precisam analisar seus próprios dados genômicos, profissionais de computação e cientistas de dados interessados em ciências da vida e profissionais de aquicultura e biotecnologia que trabalham com genômica aplicada. Recomenda-se graduação em biologia, ciências do mar, biotecnologia, bioquímica, ciência da computação, matemática ou área afim, ou experiência profissional em laboratório ou em análise de dados.
- Idioma: domínio suficiente do português para acompanhar as aulas e a documentação técnica.
- Recursos técnicos: um computador com conexão estável à internet, um navegador atualizado e uma câmera para as sessões ao vivo e a apresentação de projetos.
- Admissão: inscrição online, análise do seu perfil e uma breve entrevista com a equipe acadêmica.
- 01InscriçãoSeus dados, histórico e documentos.
- 02Análise imediataVerificamos se está tudo completo e em ordem.
- 03MatrículaEscolha pagamento à vista ou parcelado e garanta sua vaga.
A admissão é provisória até que o comitê valide os documentos apresentados. Se você não cumprir os requisitos, o valor integral será reembolsado.
Fale com a gente antes de se matricular
Deixe seus dados e a equipe de admissões vai escrever para você e tirar todas as suas dúvidas. Se você já decidiu, pode se inscrever e pagar na mesma sessão.