Curso de Especialização em Genómica Oceânica e DNA Ambiental (eDNA)
Este curso de especialização prepara-o para utilizar a genómica e o DNA ambiental (eDNA) como ferramentas de estudo e monitorização da vida marinha. Aprenderá a conceber amostragens de água e sedimento, a evitar a contaminação das amostras, a aplicar metabarcoding e PCR quantitativa, a processar dados de sequenciação e a interpretar os resultados com prudência, com aplicações na monitorização da biodiversidade, na deteção de espécies invasoras ou protegidas, na gestão das pescas e na avaliação ambiental.
Avaliação de conhecimentos prévios
Estas são as competências que este programa proporciona. Assinale as que já domina e indicamos-lhe que parte do plano de estudos é a sua.
Parte do zero nesta área. O programa foi pensado precisamente para isso.
O que é o programa Curso de Especialização em Genómica Oceânica e DNA Ambiental (eDNA)?
Este curso de especialização prepara-o para ler a biodiversidade do oceano na sua pegada genética. Aprenderá os fundamentos do DNA, os marcadores genéticos, as tecnologias de sequenciação, os genomas de referência e as bases de dados de sequências, como o eDNA se origina, degrada e desloca na água e nos sedimentos, como conceber amostragens de campo com controlos adequados e prevenção da contaminação, como se extrai, amplifica e prepara o DNA para sequenciação de alto rendimento, como se filtram as leituras, se agrupam em ASV e se atribui a taxonomia com ferramentas abertas, e como se interpretam deteções, falsos positivos e abundância para a gestão marinha.
O que distingue este curso de especialização: a cobertura de todo o fluxo de trabalho, do campo e do laboratório à bioinformática e à interpretação; o foco numa técnica em rápido crescimento que está a ser integrada em programas de monitorização em todo o mundo; bioinformática prática com processamento de leituras e atribuição taxonómica com ferramentas abertas; um olhar crítico sobre os limites, os enviesamentos e as boas práticas na interpretação de resultados; uma estrutura aprofundada de oito módulos, dos fundamentos genómicos às aplicações de gestão; e um caso prático em que concebe um estudo completo de eDNA marinho.
Destaques do programa
- Da amostra ao dado: todo o fluxo de trabalho de campo, laboratório, bioinformática e interpretação.
- Técnica em rápido crescimento: o eDNA está a ser integrado em programas de monitorização em todo o mundo.
- Bioinformática prática: processamento de leituras e atribuição taxonómica com ferramentas abertas.
- Olhar crítico: limites, enviesamentos e boas práticas para interpretar resultados.
- Aplicações de gestão: biodiversidade, espécies invasoras, pescas e avaliação de impacto.
- Caso prático: a conceção completa de um estudo de eDNA marinho.
Plano de estudos do programa Curso de Especialização em Genómica Oceânica e DNA Ambiental (eDNA)
8 módulos. Selecione um módulo para consultar o respetivo conteúdo.
Fundamentos de genómica marinha
- 1.1. DNA, genes e genomas
- 1.2. Marcadores genéticos
- 1.3. Tecnologias de sequenciação
- 1.4. Genomas de referência marinhos
- 1.5. Bases de dados de sequências
- 1.6. Código de barras de DNA
- 1.7. Genómica de populações
- 1.8. Ética e uso de dados genéticos
O DNA ambiental no oceano
- 2.1. O que é o DNA ambiental
- 2.2. Origem e degradação do eDNA
- 2.3. Transporte do eDNA na água
- 2.4. eDNA em sedimentos
- 2.5. RNA ambiental
- 2.6. Comparação com os métodos tradicionais
- 2.7. Vantagens e limitações
- 2.8. Estado atual da técnica
Desenho de amostragem e trabalho de campo
- 3.1. Objetivos e perguntas do estudo
- 3.2. Desenho espacial e temporal
- 3.3. Filtração de água
- 3.4. Amostragem de sedimentos
- 3.5. Amostradores automáticos
- 3.6. Controlos de campo
- 3.7. Prevenção da contaminação
- 3.8. Conservação e transporte
Técnicas laboratoriais
- 4.1. Organização do laboratório
- 4.2. Extração de DNA
- 4.3. Seleção de primers
- 4.4. PCR e metabarcoding
- 4.5. PCR quantitativa e digital
- 4.6. Preparação de bibliotecas
- 4.7. Sequenciação de alto rendimento
- 4.8. Controlos e réplicas
Bioinformática para eDNA
- 5.1. Formatos de dados de sequenciação
- 5.2. Controlo de qualidade das leituras
- 5.3. Eliminação de erros e quimeras
- 5.4. Variantes de sequência de amplicão (ASV)
- 5.5. Atribuição taxonómica
- 5.6. Bases de dados de referência e as suas lacunas
- 5.7. Análise da diversidade
- 5.8. Fluxos de trabalho reprodutíveis
Análise e interpretação de resultados
- 6.1. Deteção e não deteção
- 6.2. Falsos positivos e negativos
- 6.3. Modelos de ocupação
- 6.4. Relação com a abundância
- 6.5. Comparação entre amostras
- 6.6. Visualização de resultados
- 6.7. Incerteza
- 6.8. Comunicação de resultados
Aplicações na gestão marinha
- 7.1. Monitorização da biodiversidade
- 7.2. Deteção precoce de espécies invasoras
- 7.3. Espécies raras e protegidas
- 7.4. Gestão das pescas
- 7.5. Monitorização de áreas marinhas protegidas
- 7.6. Avaliação de impacto ambiental
- 7.7. Vigilância em portos e águas de lastro
- 7.8. Normalização e protocolos
Caso prático: estudo de eDNA marinho
- 8.1. Definição do objetivo
- 8.2. Seleção de locais
- 8.3. Plano de amostragem
- 8.4. Protocolo laboratorial
- 8.5. Plano bioinformático
- 8.6. Análise de dados
- 8.7. Interpretação e recomendações
- 8.8. Apresentação do estudo
Duração e modalidade do programa Curso de Especialização em Genómica Oceânica e DNA Ambiental (eDNA)
São 800 horas. Indique quantas pode dedicar por semana e dizemos-lhe quando termina realmente.
É o ritmo com que a maioria dos alunos termina. Adapta-se bem ao plano de prestações.
Direção académica e corpo docente
A equipa docente da Navalis: profissionais no ativo que lecionam e supervisionam os programas.
Dra. Marina AlcoverDiretora académica e responsável pela garantia da qualidade
Eng. Diego CifuentesProfessor associado de Soldadura Naval e Ensaios Não Destrutivos; responsável de QA/QC de juntas soldadas
Cmdt. Javier Abaroa (MCA)Professor associado de Manobra, Navegação Eletrónica (ECDIS/Radar/ARPA) e GMDSS; coordenador de conformidade STCW e gestão de recursos na ponte
Dr. Pau FerrerProfessor associado de Arquitetura Naval e Simulação; diretor do Laboratório de Hidrodinâmica e CFD
Dra. Nuria LlobregatProfessora associada de Meteorologia Marítima, SAR e Segurança Operacional; coordenadora de gestão de riscos na navegação
Eng. Javier BañulsProfessor associado de Eletrotecnia, Automação e Engenharia ETO; coordenador de integração eletrónica e alarmes de máquinas
Eng. Sofía MarquinaProfessora associada de Materiais, Compósitos e Proteção Anticorrosiva; coordenadora da linha de tintas e revestimentos avançados
Eng. Tomás RieraProfessor associado de Propulsão, Energias Alternativas e Sistemas Híbridos; coordenador de desempenho energético e vibraçõesObjetivos do programa Curso de Especialização em Genómica Oceânica e DNA Ambiental (eDNA)
Saídas profissionais do programa Curso de Especialização em Genómica Oceânica e DNA Ambiental (eDNA)
Perguntas sobre o programa Curso de Especialização em Genómica Oceânica e DNA Ambiental (eDNA)
Não é imprescindível. Utilizam-se ferramentas bioinformáticas guiadas e explicam-se os comandos básicos.
Não totalmente. É uma ferramenta complementar com vantagens e limitações que o curso analisa.
Apenas de forma limitada; o curso explica o que se pode e não se pode inferir.
Sim. Analisam-se conjuntos públicos de dados de sequenciação de estudos marinhos.
Elabora a conceção completa de um estudo de eDNA, da amostragem à interpretação.
Totalmente online, através de um campus virtual disponível 24 horas por dia, 7 dias por semana, com sessões em direto que ficam gravadas e tutorias com a equipa académica.
O curso de especialização inclui 800 horas de estudo distribuídas por 8 módulos de cerca de 100 horas cada e termina com um caso prático. Pode avançar ao seu ritmo dentro do calendário definido no momento da inscrição.
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Processo de admissão
Sem esperar por um telefonema. Se a documentação estiver em ordem, inscreve-se na mesma sessão.
- Perfil: dirigido a licenciados em biologia, ciências do mar ou ciências do ambiente que queiram acrescentar ferramentas genómicas às suas competências, técnicos de monitorização ambiental que procuram métodos de amostragem não invasivos, gestores de áreas marinhas protegidas que precisam de monitorizar espécies e habitats, profissionais das pescas e da aquacultura interessados na identificação de espécies e investigadores que queiram aplicar o eDNA nos seus projetos. Recomenda-se uma licenciatura em biologia, ciências do mar, ciências do ambiente, biotecnologia ou área afim, ou experiência profissional em monitorização ambiental ou trabalho laboratorial.
- Idioma: domínio suficiente do português para acompanhar as aulas e a documentação técnica.
- Recursos técnicos: um computador com ligação estável à internet, um navegador atualizado e uma câmara para as sessões em direto e a apresentação de projetos.
- Admissão: candidatura online, análise do perfil e uma breve entrevista com a equipa académica.
- 01CandidaturaDados pessoais, percurso e documentos.
- 02Verificação imediataConfirmamos que está tudo completo e em ordem.
- 03InscriçãoEscolha pronto pagamento ou prestações e reserve o seu lugar.
A admissão é provisória até que a comissão valide a documentação apresentada. Se os requisitos não forem cumpridos, o montante é reembolsado na totalidade.
Pergunte-nos antes de se inscrever
Deixe os seus dados e os serviços de admissão entrarão em contacto por escrito para esclarecer o que precisar. Se já tem a decisão tomada, pode avançar diretamente para a candidatura e pagar na mesma sessão.